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前沿速递|9月病原体RNA研究新进展

9月,有关HBV RNA的研究取得了一些新的进展,主要是研究HBV pgRNA与HBV相关肝内胆管癌的恶性表型及术后生存相关和HBV pgRNA的m?A修饰与病毒复制活性及肝损伤程度密切相关。

01


Hepatitis B virus pregenomic RNA is associated with malignant phenotypes and postoperative survival in HBV-related intrahepatic cholangiocarcinoma

(乙型肝炎病毒前基因组RNA与HBV相关肝内胆管癌的恶性表型及术后生存相关)

发表期刊:Infectious Agents and Cancer

研究机构:海军医科大学东方肝胆医院

通讯作者:Jian Yu、Gang Huang


内容摘要

研究背景:

慢性HBV感染是iCCA发生的潜在诱因,HBV感染与胆管癌风险升高相关,但残余HBV转录信号与iCCA生物学行为之间的关系仍未完全阐明。循环HBV RNA/pgRNA已成为反映持续HBV转录的候选标志物。在HBV相关肝细胞癌的研究中,pgRNA被认为与干性相关表型和临床结局相关,机制上,已有研究报道pgRNA与RNA结合蛋白IGF2BP3之间存在相互调控。在本研究中,我们旨在明确pgRNA的组织分布和上皮定位,评估pgRNA过表达是否与iCCA细胞的恶性和干性相关表型相关,并探讨术前血清pgRNA状态与术后结局的探索性关联。

研究方法:

单中心回顾性研究纳入45例长期NA治疗、术前HBV DNA被抑制并接受根治性切除的HBV-iCCA患者;qRT-PCR检测组织pgRNA,SAT方法定量血清pgRNA,IF-FISH看空间定位;构建HuCCT1/RBE pgRNA过表达模型评估活力、迁移、侵袭、集落形成及干性蛋白;Kaplan-Meier、Cox、RMST分析生存。

研究结果:

肿瘤组织中的pgRNA表达显著低于配对的癌旁非肿瘤肝组织(P=0.010)。在15例血清pgRNA可定量的患者中,血清pgRNA与肿瘤组织pgRNA无显著相关性(Spearman ρ=0.314;P=0.254),但与癌旁非肿瘤组织pgRNA呈中等正相关(ρ=0.532;P=0.044)。体外功能实验显示,pgRNA过表达细胞模型表现出恶性表型增强。蛋白质印迹和光密度分析显示,pgRNA过表达后多种干性相关蛋白的表达增加。所有患者纳入OS分析,三组术前血清pgRNA的OS存在显著整体差异(log-rank P<0.001),HIGH组(>2700 copies/mL)的OS最差,而LOW(100-2700 copies/mL)和BLQ组(<100 copies/mL)的曲线更为相似。所有患者纳入RFS分析,三组血清pgRNA的RFS存在显著整体差异(log-rank P<0.001),单变量分析中HIGH组的RFS事件风险更高(HR=5.63,95% CI 2.15-14.74;P<0.001),而LOW与BLQ无显著差异。

研究结论:

HBV pgRNA与两种iCCA细胞模型的恶性和干性相关表型相关。在长期NA治疗且血清HBV DNA被抑制的患者中,术前高水平血清pgRNA与术后更差的OS和RFS相关。


02


pgRNA-m6A levels associate with HBV replication and liver function(pgRNA-m?A水平与HBV复制及肝功能相关)

发表期刊:Epigenetics

研究机构:武汉大学中南医院等

通讯作者:Song-Mei Liu、Yidan Zhou


内容摘要

研究背景:

证据表明,cccDNA分子在HBV持续感染、HBV抗原的肝脏免疫耐受、抗病毒治疗后的病毒学反弹及耐药发生中起关键作用,因此肝内HBV cccDNA和血清pgRNA可作为HBV持续存在的生物标志物。m?A修饰已被证实参与调控HBV RNA表达,但HBV pregenomic RNA(pgRNA)的m?A水平是否与HBV复制及肝功能相关仍不清楚。本研究采用T3 DNA连接酶法检测HBV阳性患者血清pgRNA-m?A水平,结果显示血清pgRNA-m?A水平与pgRNA表达、HBV DNA拷贝数、肝功能指标均相关,首次报道了人血清中存在pgRNA-m?A,为理解病毒活跃复制提供了依据。通过TRADES m?A编辑系统位点特异性操控pgRNA-m?A甲基化,我们发现去除pgRNA的m?A修饰可阻碍HBV复制和感染,为抗HBV治疗提供了新的潜在靶点。

研究方法:

研究采用T3 DNA连接酶法检测50例HBV感染者血清中pgRNA-m?A水平,通过TaqMan法和RT-qPCR分别定量HBV DNA拷贝数与pgRNA表达,并结合肝功能指标评估肝损伤。细胞实验使用Tet-off稳定产毒细胞系HepAD38,利用靶向RNA去甲基化SunTag系统(TRADES)对pgRNA 1907位点进行特异性m?A编辑,通过SELECT-qPCR验证编辑效率,并检测HBV标志物、细胞因子及抗病毒基因表达变化。

研究结果:

血清pgRNA-m?A水平与HBV DNA拷贝数(r=0.3465, p=0.0137)、pgRNA表达(r=0.5636, p<0.0001)及ALT、AST等肝功能指标呈显著正相关。高病毒载量组(HBV DNA>1.0×10? IU/mL)的pgRNA-m?A和pgRNA水平均显著高于低载量组。TRADES介导的pgRNA 1907-m?A特异性去甲基化后,HBV DNA、HBeAg和pgRNA水平明显下降,同时干扰素α2(IFN-α2)和APOBEC3A表达显著上调,IL-6分泌减少。

研究结论:

HBV pgRNA的m?A修饰与病毒复制活性及肝损伤程度密切相关,位点特异性m?A去甲基化可有效抑制HBV复制并激活部分天然免疫通路。该发现不仅为理解HBV表观转录组调控提供了临床依据,也为开发靶向pgRNA-m?A的新型抗HBV治疗策略指明了方向。




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上海仁度生物科技股份有限公司(股票代码:688193)成立于2007年,是国内最早一批专注于RNA分子诊断技术和产品的生命科学企业之一,致力于开发临床需求尚未满足的创新诊断技术和产品。公司拥有RNA实时荧光恒温扩增(SAT)的独家专利技术平台,以该技术平台为基础自主研发了一系列分子诊断试剂和设备一体化产品,专注于为生殖、呼吸、消化、血液、食品、环境安全等领域病原体的精准诊断、有效防控和个性化诊疗提供解决方案。

仁爱生命 度衡健康专注病原体RNA临床检测

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