表观遗传技术例如ATAC-seq、CUT&Tag都需要使用高质量的细胞或细胞核进行实验,然而,如何从组织样本中制备高质量的细胞核成为了这些表观实验的限制因素;在CUT&Tag实验中,转录因子由于其动态或间接与基因组结合的特点,不太容易被稳定捕获到,尤其是低丰度转录因子的结合信号捕获,成为了表观实验的又一“瓶颈”。
为解决以上难题,诺唯赞深入钻研,经过不断创新优化与验证,推出了两款表观研究“加速器:
为您的研究提供全方位的助力,让每一环都更加高质、高效,加速您的科学发现进程!
植物组织提核
不再担心细胞核质量
诺唯赞植物组织提核试剂盒(Vazyme #NH101)——采用精心优化的密度梯度离心法,有效减少杂质、细胞器、次级代谢物的污染,只需50 min即可获得纯净且完整的细胞核,适用于下游的表观遗传实验。
图1. 植物组织提核试剂盒(Vazyme #NH101)
我们使用Vazyme #NH101对多种新鲜/冻存的植物组织样本进行细胞核提取,并使用表观组学中对细胞核质量要求最高的ATAC-seq (Vazyme #TD711)进行染色质完整性评价,结果显示均获得了良好的TSS富集和IGV信噪比。
图2. 多种植物组织提核镜检
图3. 植物组织ATAC文库大小分布图
图4. 植物组织ATAC文库TSS富集热图
图5. 植物组织ATAC文库IGV信号图
ATAC-seq对细胞核完整性要求非常高,诺唯赞植物组织提核试剂盒(Vazyme #NH101),能很好地保护细胞核,有效维持染色质的初始状态,让植物ATAC的富集“美好如初”!
转录因子CUT&Tag
不再担忧信号稳定性
诺唯赞CUT&Tag转录因子增强模块(Vazyme #TD904-C2),采用抗原信号稳定暴露,非靶点封闭,以及蛋白核酸固定技术,确保获取高信噪比的转录因子CUT&Tag数据。
我们使用Vazyme #TD904-C2对10万个Hela细胞进行处理,以不同丰度的转录因子为目标蛋白,使用Vazyme #TD904进行CUT&Tag建库。结果表明,TF Enhancer模块能够显著提升TSS富集和IGV视图信噪比,且阴性对照IgG无信号富集(无假阳性),实现了对转录因子的高灵敏度真实信号检测。
图6. 转录因子CUT&Tag TSS富集热图
TD904-C2表示Vazyme #TD904-C2处理样本,
Normal表示未处理样本
图7. 转录因子CUT&Tag IGV视图
TD904-C2表示Vazyme #TD904-C2处理样本,
Normal表示未处理样本
Vazyme #TD904-C2操作简单,与CUT&Tag建库试剂盒TD904“王炸”搭配,精准捕获转录因子结合位点。
与植物提核Vazyme #NH101强强联用,可进一步替代复杂的植物ChIP-seq传统方法,助力植物表观遗传研究迈向新的台阶!
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诺唯赞表观遗传解决方案
提供染色质结构、蛋白-DNA互作、表观修饰系列产品,加速您的表观调控机制研究!
图8. 诺唯赞表观遗传学系列产品
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